| Family | subfamily | Genus | Species | |
|---|---|---|---|---|
| Hydrocharitaceae | Egeria Planch. | Egeria densa Planch. | Details | |
| Gramineae (Poaceae) | Oryzoideae | Ehrharta Thunb. | Ehrharta calycina Sm. | Details |
| Elatinaceae | Elatine L. | Elatine macropoda Guss. | Details | |
| Cyperaceae | Eleocharis R.Br. | Eleocharis dulcis (Burm.f.) Trin. ex Hensch. | Details | |
| Cyperaceae | Eleocharis R.Br. | Eleocharis palustris subsp. iranica Kukkonen | Details | |
| Cyperaceae | Eleocharis R.Br. | Eleocharis geniculata (L.) Roem. & Schult. | Details | |
| Cyperaceae | Eleocharis R.Br. | Eleocharis caduca (Delile) Schult. | Details | |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Eleusine Gaertn. | Eleusine indica (L.) Gaertn. | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Eleusine Gaertn. | Eleusine africana Kenn.-O’Byrne | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Panicoideae | Elionurus Humb. & Bonpl. ex Willd. | Elionurus royleanus Nees ex A.Rich. | Details |
| Hydrocharitaceae | Elodea Michx. | Elodea canadensis Michx. | Details | |
| Araceae | Aroideae | Eminum (Blume)Shcott | Eminum spiculatum (Blume)Shcott subsp. spiculatum | Details |
| Cruciferae (Brassicaceae) | Enarthrocarpus Labill. | Enarthrocarpus strangulatus Boiss. | Details | |
| Cruciferae (Brassicaceae) | Enarthrocarpus Labill. | Enarthrocarpus lyratus (Forssk. | Details | |
| Cruciferae (Brassicaceae) | Enarthrocarpus Labill. | Enarthrocarpus pterocarpus (Pers.) DC. | Details | |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Enneapogon P.Beauv. | Enneapogon scaber Lehm. | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Enneapogon P.Beauv. | Enneapogon desvauxii P.Beauv. | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Enneapogon P.Beauv. | Enneapogon persicus Boiss. | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Enneapogon P.Beauv. | Enneapogon lophotrichus Chiov. ex H. Scholz & P. König | Details |
| Ephedraceae | Ephedra L. | Ephedra foeminea Forssk. | Details | |
| Ephedraceae | Ephedra L. | Ephedera aphylla Forssk.. | Details | |
| Ephedraceae | Ephedra L. | Ephedra ciliata Fisch. & C.A.Mey. | Details | |
| Ephedraceae | Ephedra L. | Ephedra alata Decne. | Details | |
| Ephedraceae | Ephedra L. | Ephedra pachyclada subsp. sinaica (Riedl) Freitag & Maier-St. | Details | |
| Onagraceae | Epilobium L. | Epilobium hirsutum L. | Details | |
| Orchidaceae | Epipactis Zinn. | Epipactis veratrifolia Boiss. & Hohen | Details | |
| Equisetaceae | Equisetum L. | Equisetum ramosissimum Desf. | Details | |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Eragrostis Wolf | Eragrostis minor Host | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Eragrostis Wolf | Eragrostis pilosa (L.) P.Beauv. | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Eragrostis Wolf | Eragrostis aegyptiaca (Willd.) Delile | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Eragrostis Wolf | Eragrostis ciliaris (L.) R. Br. | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Eragrostis Wolf | Eragrostis cilianensis (All.)Vignolo ex Janch. | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Eragrostis Wolf | Eragrostis barrelieri Daveau | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Eragrostis Wolf | Eragrostis aspera (Jacq.) Nees | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Eragrostis Wolf | Eragrostis japonica (Thunb.) Trin. | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Eragrostis Wolf | Eragrostis lepida (Hochst. ex A. Rich.)Hochst. ex Steud. | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Eragrostis Wolf | Eragrostis tenella (L.) P. Beauv. ex Roem & Schult. | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Chloridoideae | Eragrostis Wolf | Eragrostis tef (Zucc.) Trotter | Details |
| Cruciferae (Brassicaceae) | Eremobium Boiss. | Eremobium aegyptiacum var. lineare (Delile) Zohary | Details | |
| Cruciferae (Brassicaceae) | Eremobium Boiss. | Eremobium aegyptiacum (Spreng.) Asch. & Schweinf. ex Boiss. | Details | |
| Caryophyllaceae | Alsinoideae | Eremogone Fenzl | Eremogone picta (Sm.) Dillenb. & Kadereit | Details |
| Gramineae (Poaceae) | Pooideae | Eremopyrum (Ledeb.) Jaub. & Spach | Eremopyrum bonaepartis (Spreng.) Nevski | Details |
| Compositae (Asteraceae) | Asteroideae | Erigeron L. | Erigeron bonariensis L. | Details |
| Geraniaceae | Erodium L'Hér. ex Aiton | Erodium crassifolium L'Hér. ex Aiton | Details | |
| Geraniaceae | Erodium L'Hér. ex Aiton | Erodium oxyrhinchum subsp. bryoniifolium (Boiss.) Schönb.-Tem. | Details | |
| Geraniaceae | Erodium L'Hér. ex Aiton | Erodium oxyrhinchum M.Bieb. subsp. oxyrhynchum | Details | |
| Geraniaceae | Erodium L'Hér. ex Aiton | Erodium chium (Burm.f.) Willd. | Details | |
| Geraniaceae | Erodium L'Hér. ex Aiton | Erodium arborescens (Desf.) Willd. | Details | |
| Geraniaceae | Erodium L'Hér. ex Aiton | Erodium glaucophyllum (L.) L'Hér. | Details | |
| Geraniaceae | Erodium L'Hér. ex Aiton | Erodium gruinum (L.) L'Hér. | Details |